آیت‌الله جنتی واکنش های متفاوتی به سهمیه‌بندی بنزین در دولت‌های احمدی‌نژاد و روحانی داشته است.
او ۲۹ آبان ۱۳۹۸، پنج روز بعد از سهمیه بندی بنزین در دولت روحانی در جلسه شورای نگهبان گفت: جلب نظر مردم و اقناع آن‌ها و حمایت نخبگان، مقدمه اجرای طرح افزایش قیمت بنزین بود که مغفول واقع شد. مسئولان می‌بایست برای چنین جراحی مهمی از مدت‌ها پیش اذهان و افکار عمومی را آماده می‌کردند و از فواید چنین طرحی همچون واریز بسته حمایتی که برای خود مردم مفید بود، سخن می‌گفتند و درمقابل به مضرات ارزانی بنزین همچون قاچاق گسترده سوخت اشاره می‌کردند که متأسفانه این اقدام به خوبی صورت نگرفت.
بیشتر بخوانید: جنجال بی‌پایان نحوه شناسایی مشمولان یارانه معیشتی
همه آن‌هایی که اعتراض کردند و به خیابان‌ها آمدند از اشرار نبودند و دغدغه‌های مردم باید درک شود؛ اکنون هم گرانی وجود دارد و اگر بخواهد این طرح، فشار جدیدی به اقشار ضعیف وارد کند، صحیح نیست.
آیت الله جنتی، ۸ تیر ۱۳۸۶، سه روز بعد از سهمیه بندی بنزین در دولت احمدی‌نژاد در نماز جمعه تهران در واکنش به این طرح گفت: این کاری بود که بالاخره باید صورت می‌گرفت و به نفع همه مردم، نظام و مملکت است.
مسأله سهمیه‌بندی بنزین کاری بود که سال‌ها مجلس و دولت به فکر آن بود و اقدام بسیار پسندیده‌ای هم است؛ زیرا درست نیست هرچه نفت داریم، بفروشیم، بنزین بخریم و آن را بسوزانیم و تنها هوای مملکت را فاسد کنیم. شیوه کار و اجرای این مسأله وضعیت خاص خود را دارد. البته ممکن است ابتدای کار چون تجربه اول است، تنش‌هایی به وجود بیاید؛ اما به تدریج عوارض این مسأله هم از بین می‌رود. درست نیست سرمایه‌های عظیم نفتی که برای ساختن آینده کشور است، بهای بنزین شده و دود شود و به هوا رود.
